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Struttura del corso
Introduzione a Fiji e ImageJ
- Panoramica delle Figi e delle sue applicazioni nella ricerca scientifica
- Comprendere l'architettura e i plugin di ImageJ
- Installazione e configurazione di Fiji per prestazioni ottimali
Tecniche di base di elaborazione delle immagini
- Formati di acquisizione e importazione delle immagini
- Regolazione del contrasto, della luminosità e applicazione dei filtri
- Metodi di impilamento e proiezione delle immagini
Avanzato Image Analysis
- Tecniche di segmentazione: sogliatura e rilevamento dei bordi
- Conteggio degli oggetti e analisi delle particelle nei campioni istologici
- Misurazione di aree, perimetri e altre caratteristiche morfologiche
Lavorare con Biocampioni logici
- Elaborazione di immagini di tessuti istologici, cellule del sangue e alghe
- Deconvoluzione del colore e analisi dei tessuti colorati
- Analisi time-lapse e tracciamento del movimento cellulare
Automazione e personalizzazione
- Creazione ed esecuzione di macro per attività ripetitive
- Utilizzo dei plugin Fiji per analisi specializzate
- Scripting di base con ImageJ Macro Language (IJM)
Data Management e Segnalazione
- Esportazione dei risultati e generazione di report
- Annotazione delle immagini e preparazione dei dati per la pubblicazione
- Le migliori pratiche per l'analisi delle immagini riproducibili
Riepilogo e passaggi successivi
Requisiti
- Conoscenza di base dei concetti di imaging biologico
- Familiarità con la microscopia e le tecniche istologiche
- Conoscenze informatiche di base
Pubblico
- Ricercatori in biotecnologia e tossicologia ambientale
- Tecnici di laboratorio che lavorano con l'imaging istologico e cellulare
- Scienziati interessati all'analisi quantitativa delle immagini
14 ore
